1948年3月建院，时称桓台县政府机关卫生所，院址桓台县新城镇。
1949年6月，改称为“桓台县大众医院”。
1950年1月，改称为“淄博区桓台县卫生院”。4月，随县政府迁至索镇乌河桥西南侧。
1959年3月，因桓台县、博兴县合并，改称为“博兴县第二人民医院”。
1961年11月，桓台县恢复，医院定名为“桓台县人民医院”。
1965年11月，医院搬迁至卫生街2号。
1995年11月，经山东省医院评审委员会评为二级甲等医院。
2000年，成立桓台县老年人保健服务中心，桓台县卫校改称“桓台县卫生技术培训中心”，均纳入医院管理。
2004年12月28日，桓台大道2198号新院奠基。
2007年，与山东大学齐鲁医院合作办医，加挂“山东大学齐鲁医院桓台分院”牌子。
2009年7月8日，新院正式投入使用。
2014年4月，经淄博市卫生局评审，通过二级甲等综合医院复审。6月，成为齐鲁医药学院非隶属附属医院。
2015年7月，通过山东省卫生和计划生育委员会评审，成为三级乙等综合医院。
2020年5月，经淄博市人民政府批准，纳入市级医院行列，加挂“淄博市第九人民医院”牌子。
2021年2月，撤销桓台县卫生技术培训中心编制，中心并入医院，撤销县老年人保健服务中心编制。
2021年12月，通过山东省卫生健康委、山东省教育厅审核，成为齐鲁医药学院附属医院。
2024年10月，通过淄博市卫健委组织的综合医院等级评审。
（2024年11月30日）
